食品微生物实验室主要承担着菌落总数的测定、大肠菌群的测定等相关的实验室检测。实验室配备常用设备仪器有：水池、工作台、yao品试剂柜、高压灭菌锅、恒温培养箱、恒温振荡器、超净工作台、电子天平、水浴锅、显微镜、试管，三角瓶等。下面试广西东青华实验室讲解：
食品微生物实验室部分布局要求：
1、实验室功能间不同，部分单元需做隔断处理主要是无菌室、培养室、霉菌培养室、灭菌室、清洗室、培养基配制室等洁净类实验室。
2、霉菌培养室要单独，靠外界环境，便于通风清洁。
3、清洗室单独一间，尽量大一点，方便操作，要靠着外界环境。
4、灭菌间要邻近清洗室和培养基配制室，方便物品运输。
5、布局不能产生物流回路，沿一个方向流动，不产生交叉。
6、培养基的保存：根据标签的存放条件，可以放在专门存放的高柜里。
7、无菌室做成净化间，要保持正压，（如果有做致病菌就需要另做生物安全室，保持负压），隔断材质用净化板，光滑易清洁，无卫生死角。密封性要好。大小在 9－15 平米，太大能耗大，太小操作不方便。高度 2.3 米。
8、无菌室要有二次更衣室，人员流向、物品（包括样品、工用具、yao品、废物等）流向要思考清楚.
9、主要的电力在灭菌间，注意足够的电缆粗细。
食品车间微生物检测流程：
培养基采购储存→培养基配置→培养基灭菌→工用具器皿等灭菌
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样品接收→ 样品整理→ 无菌室操作 → 培养计数
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废弃物处理→培养物灭菌→器皿用具清洗
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