Sequencher DNA序列分析

  • 发布时间:2024-10-31 10:00:38,加入时间:2024年10月17日(距今65天)
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Sequencher DNA序列分析软件是科学家们必备的工具。持续发展和改进超过25年,Sequencher提供了无与伦比的功能特征,成千上万的出版物都有相关的应用介绍。新手用户可以以最少的时间投资产生结果,而有经验的用户会惊叹于功能的深度和控制。Sequencher自带各种专有算法,可以为Sanger, Next-Gen Sequencing (NGS)和RNA-Seq序列数据生成结果。

Sequencher 5.4.6新功能

为DNA序列分析提供了全新的和增强的功能。

Sanger

• Sequencher Connections中运行的 Primer-BLAST发送引物序列到您的Sequencher项目中。

• 在项目窗口中轻松使用一致性序列,作为NGS测序比对混合的参考序列。

• 新批量处理恢复结束命令。

• 在项目窗口中调整字体大小的功能。

NGS

• GSNAP和BWA-MEM工作流更快。

• 构建GSNAP数据库和BWA索引,这些索引可以被重新用于与整个基因组的对齐。

• 查看并保存用FastQC报告的NGS原始数据文件的质量分数和元数据。

• 使用SAMtools在您的NGS校准中标记变量来生成不同的调用文件(VCF)。

RNA-Seq

•  随着Cuffquant和Cuffnorm的添加,扩展了Cufflinks套件的功能。

• Cuffdiff和 Cuffnorm的Conditions and Replicates编辑器。

• 使用自定义排序和筛选选项来增强RNA-Seq可视化功能。

• 使用增强的外部数据浏览器轻松管理所有的DNA-Seq和RNA-Seq项目。

Sanger序列

Sequencher使传统的序列装配变得容易,同时又能让您保持对序列的控制。精简数据质量差的序列。您甚至可以创建一个整洁的标准库,让一切变得更简单。通过直观的控制,您可以为数据选择算法,包括汇编到参考中。如果您正在处理来自不同来源的多个示例,可以通过名称来对它们进行自动装配。使用工具编辑数据从来没有如此简单过,帮助您定位和处理模棱两可的问题,还可以检查杂合子并移动您的数据。使用信任值帮助修整数据、质量检查和SNP检测,以提高数据结果的质量。

Sequencher  DNA序列分析

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