张仲景写成该书后仍专心研究医学，直到与世长辞。晋武帝司马炎统一天下后的公元285年，张仲景的遗体才被后人运回故乡安葬，并在南阳修建了医圣祠和仲景墓。
“按寸不及尺，握手不及足”，和病人相对片刻，便开方抓，只知道赚昧心钱。更多的人，虽师承名医，却不思进取，因循守旧，不精心研究医方、医术，以解救百姓的病痛，而是竞相追逐权势荣耀，忘记了自己的本分。张仲景对这些人非常气愤，痛加斥责，他决心要控制瘟疫的流行，根治伤寒病。从此他“勤求古训，博采众方”，刻苦研读《素问》、《灵枢》、《八十一难》、《阴阳大论》、《胎胪录》等古代医书，继承《内经》等古典医籍的基本理论，广泛借鉴其他医家的方法，结合个人临床诊断经验，研究伤寒杂病的方法，并于建安十年（公元205年）开始着手撰写《伤寒杂病论》。
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这时候，东汉王朝四分五裂，张仲景官不能做，家也难回。于是他就到岭南隐居，专心研究医学，撰写医书。到建安十五年，终于写成了划时代的临床医学名著《伤寒杂病论》，共十六卷。经后人整理成为《伤寒论》和《金匮要略》两本书。《伤寒杂病论》系统地概括了“辨证施治”的理论，为中国中医病因学说和方剂学说的发展做出了重要贡献。后来该书被奉为“方书之祖”，张仲景也被誉为“经方大师”。
本书撰于3世纪初，作者原撰《伤寒杂病论》十六卷中的另一部分。经晋王叔和整理后，其古传本之一名《金匮玉函要略方》，共3卷。上卷为辨伤寒，中卷则论杂病，下卷记载方。后北宋校正医书局林亿等人根据当时所存的蠹简文字重予编校，取其中以杂病为主的内容，仍厘订为3卷，改名《金匮要略方论》。
《伤寒杂病论》古传本之一名《金匮玉函要略方》，被北宋翰林学士王洙发现于翰林院书库，书简共3卷，上卷为辨伤寒，中卷则论杂病，下卷记载方。后北宋校正医书局林亿等人根据当时所存的蠹简文字重予编校，取其中以杂病为主的内容，仍厘订为3卷，改名《金匮要略方论》。全书共25篇，方剂262首，列举病症六十余种。
《伤寒论》：《伤寒论》全书分为十卷，共397条，计112方。《伤寒论》是我国部理、法、方、完备的医学典籍。张仲景在汉以前的医学成就和劳动人民同疾病斗争的宝贵经验的基础上，创造性地把外感疾病错综复杂及其演变，加以总结，提出了六经分病，八纲辨证的学说思想，奠定了中医辨证论治的基础。在六经、八纲辨证的基础上，仲景运用了汗、吐、下、和、温、清、消、补的八法，对疾病进行。《伤寒论》不仅为诊疗外感疾病提出了辨证纲领和方法，同时也为中医临床各科提供了辨证和的一般性规律，对中医理论体系和临床应用体系的建设发展起到了不可替代的作用。
《伤寒论》以伤寒命名，伤寒二字有广义和、狭义之分。如《素问·热论》说：“今夫热病者，皆伤寒之类也。”广义伤寒是一切外感疾病的总称，“伤寒有五，有中风，有伤寒，有湿温，有热病，有温病。”《伤寒论》是外感疾病并包括某些杂病在内的辨证论治的专书。
