霉菌毒素的危害主要有以下几点：
一、降低饲料营养价值，影响动物机体的吸收和代谢
二、引起内分泌和神经内分泌功能紊乱，影响动物的生产性能和繁殖性能等
三、干扰动物免疫系统，造成免疫抑制
霉菌毒素对怀孕的母牛影响最为严重，容易造成不发情、早产、流产、掉犊等等。
世界每年约有25%的谷物受到霉菌的污染（CAST，1989）.中国的饲料原料污染最常见的霉菌毒素是呕吐毒素（DON）、玉米赤霉烯酮（ZON）和烟曲霉素。其中呕吐毒素和玉米赤霉烯酮在我国饲料中的检出率是100%，黄曲霉素为12.5%。饲料中霉菌毒素主要分为3类：曲霉菌、青霉菌和镰孢霉菌
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