1、营养性不育：一直营养不良，尤其高蛋白饲料，氨基酸，维生素，矿物质等缺乏或不足，公猪过肥、过瘦都可引起不育。
2、农村饲养公猪均是一家一户的散养形式，对公猪的饲养管理没有科学的方法，任其自由（1）公猪过肥：由于公猪的日粮能量水平过高，喂量过多，缺乏运动，导致公猪体况过肥，影响正常配种。公猪爬跨无力，或不能持久爬跨，无法配种。
（2）公猪过瘦：由于公猪的日粮能量水平过低，喂量不足或过稀，导致公猪体况过瘦，影响正常配种。爬跨无力，或不能持久爬跨，造成配种困难。
二、种公猪的繁殖疾病
1、初配体重和年龄偏小 部分农户为了能让公猪早日配种获利，在公猪尚未达到体成熟和性成熟时，一旦发现公猪有性行为，如有需要就立即开始配种。这样不仅缩短了公猪的使用寿命，还会使公猪性功能衰退，过早地淘汰。
2、配种强度过大 农村养殖公猪相对较少而分散，一般一个镇2－5头，基本上是几个村用一头公猪。如果几个村养母猪较多的话，公猪的配种次数就相当大，很多时一天要配种5－7头，这样的配种强度，无论公猪的营养多充足，都无法满足其配种需要。过不了多久，公猪性功能就会发生障碍。
3、公猪后期体重过大 农户淘汰公猪一般有两个方面的原因：一是公猪配种强度过大后期性功能低下；二是体重过大，母猪承受不住公猪的重量。
4、性欲低或无性欲
农村饲养的公猪发生性欲低或无性欲的现象还比较多，其原因也非常多，大致有如下几方面。
（1）疾病性不育：一般感染病毒性或细菌性传染病，体内外寄生虫病等都可造成公猪无性欲或缺乏性欲。此外，生殖器官炎症，关节炎，肌肉疼痛等均可引起交配困难或交配失败。
（2）营养性不育：一直营养不良，尤其高蛋白饲料，氨基酸，维生素，矿物质等缺乏或不足，公猪过肥、过瘦都可引起不育。
（3）精液品质差：精液品质差包括无精、精子密度低、精子活力差或有畸形精子等。营养因素，疾病因素均可导致生精能力下降，精子活力降低。
5、机能性不育
先天性生殖器官发育不全或畸形，交配或采精时阴茎受到严重损伤或受惊吓刺激，四肢有疾患，后躯或脊椎关节炎等。
公猪在配种时，性欲不旺盛，阴茎不能勃起，如过度使用或一直无配种任务，公母混养，缺乏运动，体况过肥、过瘦，年老体衰，未达到体成熟或性成熟，天气过冷、过热等均可导致不射精或阴茎不能勃起。
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