厂房设计水平的高低不仅直接影响工程建设投资和建设速度，而且还影响产品质量控制和企业经济效益，因此设计必须依据有关的法律法规、技术规范或标准，体现其科学性和规划性。化妆品生产企业应有与生产品种和规模相适应的足够面积和空间的生产建筑、附设建筑及设施，符合GMPC的生产厂房是通过认证的首要条件；GMPC的核心就是防止化妆品的生产过程中的混批、混杂、污染、交叉污染，厂房设计的原则就是依据GMPC的规定创造合理的布局和合格的生产场所。
厂区布置要合理规划生产区和非生产区，生产区应远离污染源，产区地面、路面及运输等不应对化妆品生产造成污染；化妆品生产所需的动力系统、“三废”处理系统等辅助设施不应对生产环境造成污染。生产区应有足够的面积与空间高度，并要考虑车间之间的通讯联络与适应程度，并且有足够地方合理安装生产设备和存放化妆品生产用原辅材料，避免不同化妆品的中间体之间发生混杂，以及避免由其他物质带来的交叉污染，并避免遗漏任何生产或控制步骤事故的发生。合理考虑下列房间的面积：存放待检原料、半成品的面积，工器具清洗及存放间的面积，清洁工具间的面积，原辅料的加工、处理面积，存放待处理不合格的原材料、半成品的面积等。
生产厂房要根据化妆品生产品种的要求规定一定的洁净要求，洁净度高的车间应布置在室内上风侧；洁净厂房操作室内的地面、墙壁和顶棚等，要使用发尘量小的建筑材料；生产车间四壁及顶棚应当用浅色、耐腐、耐热、防潮、防霉材料涂衬，并应当便于清洁消毒，厂房内的墙壁与天花板、地面的交接处宜做成弧形；厂房内安装的洗手池、下水道的位置应适宜，不得对化妆品生产带来污染；厂房应能防止昆虫、鸟类、鼠类等动物的进入。设计时应围绕GMPC生产工艺流程，遵守GMPC规范中有关硬件的规定，厂房设计的内容主要有总平面布置图、土建和装修设计、公用工程设计和化妆品生产工艺设计。
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