1、 从业条件不一样
两者的从业条件基本相似，只要年满18周岁，身体健康，具备必要的安全技术知识与技能都可以申请，但在文化素质方面的要求有明显的区别。
特种作业人员，更低具有初中及以上文化程度;这里特别指出的是申请危险化学品特种作业人员，应当具备高中或者相当于高中及以上文化程度。在部分省市发布的危险化学品生产企业人员安全生产从业条件如:《浙江省安全生产监督管理局关于提高我省危险化学品生产企业人员安全生产从业条件的指导意见》(浙安监管危化号)中也特别强调危险化学品作业人员至少具备高中及以上文化程度。
特种设备作业人员，有与申请作业种类相适应的文化程度。这是一个模糊的概念，没有特别的规定，相对来说要求比较低。笔者发现在某些地区或企业，部分作业人员只具备小学文化程度，也可以取得《特种设备作业人员证》。
2、 证书有效性不一样
安监总局第30号令指出:《特种作业操作证》有效期为6年，在全国范围内有效。特种作业操作证由安全监管总局统一式样、标准及编号。特种作业操作证每3年复审1次。特种作业人员在特种作业操作证有效期内，连续从事本工种10年以上，严格遵守有关安全生产法律法规的，经原考核发证机关或者从业所在地考核发证机关同意，特种作业操作证的复审时间可以延长至每6年1次。特种作业操作证申请复审或者延期复审前，特种作业人员应当参加必要的安全培训并考试合格。安全培训时间不少于8个学时。
质检总局第140号令指出:《特种设备作业人员证》的格式、印制等事项由国家质检总局统一规定。《特种设备作业人员证》每4年复审一次。对持证人员在4年内符合有关安全技术规范规定的不间断作业要求和安全、节能教育培训要求，且无违章操作或者管理等不良记录、未造成事故的，发证部门应当按照有关安全技术规范的规定准予复审合格，并在证书正本上加盖发证部门复审合格章。
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