沼渣主要是用于制作有机肥，用作农作物基肥和追肥。通过有机肥的施用，不但达到了化肥减量的目的，而且还改良了土壤。沼渣也可用于配制花卉、苗木、中药材和蔬菜育苗的营养土。
沼肥：作物秸秆、青草和畜禽粪尿等在沼气池中经微生物发酵制取沼气后的残留物。富含有机质和必需的营养元素。沼气发酵慢，有机质消耗较少，氮、磷、钾 损失少，氮素回收率达95％、钾在90％以上。沼气水加入2Kg左右功能菌后做冲施肥作旱地追肥；渣肥作水田基肥，若作旱地基肥施后应复土。沼肥出池后应 经过微生物堆放发酵12天左右再用。
沼渣制作有机肥的生产工艺流程：
(1)如果沼渣水分在70%以上时可以和辅料按3:1的重量比例进行混合，加入1%的生石灰搅拌，然后把已扩充了体积的菌剂添加到沼渣内，搅拌均匀堆放即可。
(2)搅拌好的发酵物水份应控制在 60%左右（手轻握成团，松开可以裂开三五条缝，至少保证用手使劲握不会从指缝间滴水）。
(3)把搅拌好的发酵物进行堆放，高度1.2m左右、宽度2m左右、长度不限。
(4)发酵24－48小时，温度可过到55℃以上，升温后三天可达到除臭效果。
(5)堆放发酵15-20天后可做生物型有机肥料使用。
我国是农业大国，每年产生的农作物秸秆在7亿吨以上，随着农村经济的发展和农民生活水平的不断提高，农村将农作物秸秆作为炊事燃料消耗量逐渐减少，农民将秸秆田间直接焚烧或弃置入河，对大气和水体造成一定污染；秸秆也通常用于造纸、饲料等，但这均属于粗放型的农作物秸秆利用技术。目前我国正在积极推动大型沼气工程建设，以期建立我国的生物质天然气产业，推广秸秆沼气技术，开辟了秸秆综合利用新途径，利用秸秆生产沼气前景广阔，但不少沼气工程的沼渣都没有得到较有效的利用。
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