影响羊肚菌出菇的关键核心是温度，目前已能解决升温出菇，暖棚、覆膜，
但尚不能解决降温出菇的问题，解决常年供应的办法是：早播早出（如云南海拔1700米左右地区，在十月底播种，十二月底或1月初出菇，二月底出菇结束），高寒地区种植，早播晚出、晚播晚出，选育耐温的优异资源进行驯化。
早播早出的优点是鲜品能赶在新年或圣诞节前后出菇，市场较好，早播早出的缺点则是上季农作物收成可能会受到影响、十月份受秋老虎的影响菌丝生长可能正常、突然的冬季寒流降温会影响出菇。
高寒且低温回升较慢地区的优点是在中国黑色羊肚菌类群主要分布在高寒地区，在这些区域种植本身就有较好的适应性；海拔底的地区温度回升较快，即使幼菇出的比较好，也常出现幼菇死菇和成菇畸形菇。
高寒且低温回升较慢地区的缺点则是生态脆弱、土层较薄、雪灾。
目前栽培的羊肚菌品种均属于中低温品种。
养菌温度10-20℃，催菇温度6-10℃，原基发生温度8-12℃，菇蕾生长温度15-20℃。
温度管理。早春在几周之内有4℃~16℃的温度，能刺激羊肚菌子实体形成。
如果这时温度变化剧烈，低于4℃或高出18℃，将影响子实体发育。当低气温稳定在3℃以上时，开始催菇管理。
催菇时，浇一次透水，可沟内浇大水浸润至畦面，但畦面不能有积水，然后控制温度在5℃~20℃之间，以5℃~15℃更为适宜。温度25℃时，不能超过两个小时。
出菇主要受温度影响，产量很大程度上由营养决定，一般菌霜出现后会防治营养袋，补充营养，但是菌丝吸引营养的能力很弱，营养袋中的大部分营养并未被吸收，定期喷洒益富源菌菇生态宝，可以分解土壤和营养袋中的单糖纤维素，降解为菌丝容易吸收的单糖，保证营养的充分供应，从而提高产量。
