有机肥，以牲畜粪便、生活垃圾、植物秸秆为主要原料，这种有机肥生产工艺流程大致为：原料干燥→粉碎→发酵→调配（与化肥及其他有机-无机物质混合，使氮+磷+钾含量≥4%，有机质≥30%） 作物秸秆：农作物秸秆是重要的肥料品种之一，作物秸秆含有作物所必需的营养元素有N、P、K、 Ca、s等。饼肥：菜籽饼、棉籽饼、豆饼、芝麻饼、蓖麻饼、茶籽饼等。泥肥：未经污染的河泥、塘泥、沟泥、港泥、湖泥等。 例如原材料为腐植酸或草炭，这种有机肥生产工艺里就没有发酵，可不必发酵，其余步骤同上。 有机肥生产工艺流程与有机肥生产线设备配置息息相关，一般有机肥生产线成套设备主要由发酵系统、干燥系统、除臭除尘系统、粉碎系统、配料系统、混合系统、造粒系统、筛分系统和成品包装系统组成。
其中，原料的细度的合理搭配对于有机肥生产工艺流程至关重要。原料细度越高，粘性就越好，造粒后的颗粒表面光洁度也就越高。但是在生产过程中，超比例的高细度材料的使用，易出现因粘性过好造成颗粒过大，颗粒不规则等问题。
有机肥生产工艺流程中有机肥可以分为粉状有机肥和粒状有机肥。其中，粉状有机肥工艺比较简单：检测你的原材料（比如草木灰、糠醛渣、腐植酸等）成分，知道每种原料中准确的营养成分和营养成分比例对有机肥生产工艺流程起着重要作用；一般的有机肥生产工艺流程要求达到使其氮磷钾含量超过4%，有机质超过30%，满足这样的有机肥生产工艺流程就可以混匀，粉碎和包装了。 颗粒状有机肥需要设备，湿法有机肥造粒机、转鼓造粒机、有机肥造粒机或者圆盘造粒或者对辊挤压挤压造粒等。有机肥生产工艺流程要求原料跟粉状肥基本一样，只是再需要添加粘结剂（膨润土或者凹凸棒）后，成品的颗粒需要转筒烘干机进行烘干。 以上只是介绍一些简单的笼统的有机肥生产工艺流程。
其实有机肥生产项目成本还是比较低的。需要生物菌发酵剂含量为10个/g，用量小，每发酵1000kg有机肥原料只需1kg生物菌发酵剂，只需投入二十元左右就可以生产出一吨符合国家标准的生物有机肥。
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