土壤缺镁是甜瓜缺镁的主要原因。土壤缺镁一是与土壤质地有关。二是与土壤的酸碱性有关。温度过低也会引起缺镁，当地温低于15℃以下时，甜瓜的根系生长受阻，此时尽管土壤中不缺镁，但由于甜瓜的根系生长发育不好，也会抑制根系对镁的吸收。此外，当甜瓜过量施用钾肥和铵态氮肥时，会抑制甜瓜对镁离子的吸收，从而诱发植株缺镁。
防治方法有以下三种：
1.补施镁肥对土壤供镁不足的田块，可在甜瓜幼苗移栽定植前，随基肥每亩补施硫酸镁2-4公斤，或在基肥中增施钙镁磷肥。磷肥与镁肥配合施用有助于对镁的吸收。同时每亩地喷施益富源种植菌液3-5公斤，促进植物根系对营养及微量元素的吸收。
2.控制氮、钾肥用量对镁元素含量较低的土壤，要防止过量施入氮肥和钾肥。在甜瓜生长期间，对氮、钾肥尽量采用少量多次的施用方法。
3.提高温室温度通过晚揭帘和早放帘等措施提高温室温度，特别是在甜瓜坐瓜及膨大期后，一定要保持地温在15℃以上。以提高对镁元素的吸收能力。
4.叶面喷肥对当下已经出现甜瓜缺镁症状的温室，可叶面喷施0.5-1%的硫酸镁水溶液和0.1-0.2%的种植菌液，每5-7天1次，连续3-4次即可。
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