水对于鱼类来说就如空气对于我们人来说是赖以生存的环境，较好的水体能减少鱼类疾病的发生，更便于鱼类的生长和生存。在实际生产中，一般会参照水体颜色、氨氮含量、底泥颜色等的改变来判断水体的好坏。
1.红水 池塘水色变红主要是因为硅甲藻或金藻成了优势种群群而引发，一般情况没有事情，但一旦天气突变，会造成藻类的大量衰减甚至死亡，便会造成毒素而致水体恶性，甚至直接引发鱼中毒死亡。所以，池水一旦变红，一定要及时改良。在天气晴好时，先用水产专用em菌泼洒消毒，第2天再用泼洒1遍，3天后再视情况进行泼洒1次。
2.黑水 当池水呈黑色，表明池中增多有机质未得到及时转化，如残饵、动物残体、排泄物、池底腐殖物等，这些物质腐败后，消耗大量溶氧，极易造成硫化氢、氨氮、亚硝酸盐等一些化学有害物质，会危害水产动物的身体健康，使其免疫力下降，引发病原微生物侵染，甚至发生鱼泛塘现象。一旦发现有这样的黑水时候，第1天～第2天分别施用1次双氧氯等含氯药物，氧化过多有机质，待3天后，用水产养殖em菌液进行全池泼洒1次。
3.白浊水 当池水变为白色浑浊的水质时，说明池塘内的有机物耗氧过大，相对而言，将大型的有机物分解成营养盐类的微生物很少，导致浮游植物得不到营养而大量消减死亡，池中物质循环遭受到破坏，池水接近老化，且严重缺氧，这种池塘内的鱼大致是在凌晨至天亮太阳升起前易发生浮头。若发现池内的水为白色浑浊时，第1天施用水产em菌液泼洒养殖池，使有机物质在絮凝后被氧化，第2天全池再施用水产养殖em菌1次，来增加池中活性em菌的含量，促进水体的循环进而改善水质。
4.氨氮含量过大的水 在喂食水产动物高蛋白质饲料、新鲜肉类或以活鱼为食的精养鱼塘，如螃蟹池、对虾池、乌鳢池、鳜鱼池等，如果在平时养殖管理中投入增多高蛋白的饵料后，新陈代谢产物中氨氮含量过大，会影响搭配水产动物的生长发育，使其免疫力下降，很容易就造成了寄生虫或病原微生物的入侵感染。所以，以高蛋白质饲料、新鲜肉类或以活鱼为食的精养塘，每隔10天～15天施用氨净或池底净1次，及时降解氨氮。如果通过水体检测，发现池水中氨氮含量总数超标时，应及时向池中施用水产养殖em菌液，第3天再用水产专用em菌稀释液泼洒1次，以增加池中活性微生物，促进浮游生物的繁衍生长，增强水体的物质循环能力。
5.臭水 因为池水腐殖质沉积，动物残体、残饵、粪便放入池底后进行腐败分解，导致池塘的底泥出现发黑、发臭现象，从而极易造成甲烷、硫化氢、亚硝酸盐等化学有毒物质，容易对生活在中下层的水产动物造成危害，如鲫鱼、草鱼、青鱼、螃蟹、虾类、鳜鱼等品种。情况严重时池塘中下层的水产动物常浮于中上层，不会在正常生活的水层中。如发生上述情况，每隔10天～15天要施用1次产养殖专用em菌，以增加有益微生物的含量，加速放入池底的有机质或腐殖质的转化，防止底泥发黑、发臭及造成甲烷、硫化氢、亚硝酸盐等化学有毒物质。
水有藻色也有透明度，是水质好的体现，表明藻好，但水中有机氮不多。
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