其峰先生画花鸟，总是力求形神兼备，重视结构、比例甚至透视的准确描绘，而不以变形、装饰为宗。这源自小写意绘画的主流传统，亦与先生曾师从徐悲鸿有关。但先生画山水，则以意求之，不取一丘一壑的形似，如苏东坡所说，求其常理而不求其常形。其《题黄山图》曰：“吾画黄山，不知其何峰，亦不知其何名，但求神似，不为迹缚。”
“但求神似，不为迹缚”八个字，恰当描述了他的山水画追求。大致说来，其山水画，可分为相对疏朗恣纵的意笔之作、相对繁密工整的勾皴之作、意笔勾点加淋漓泼墨之作三大类。小笔，秃毫，率多以行草入画，随着感觉笔笔生出，而不斤斤于斧劈、披麻诸皴法，忽平远，忽高远，忽深远，或兼而有之，画法多变，不拘一格，而又不失其规矩法度。
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先生向以教书育人为己任，他的花鸟、山水和书法作品，在抒情寄意的同时，常常自觉不自觉流露出适应教学、传授画法的热情。这些山水虽非为教学而画，但种种笔法、墨法、点法、构图法俱在其中，作为教材和范画，不似画谱而胜似画谱。它们的出版，给美术学子以亲授般的指导，是可以期待的。
孙其峰早年多画山水，后来偏重于花鸟画的创作，尤喜画雄鹰、松鼠和竹、梅、松、柏等，他重视传统书画的笔墨神韵，兼融西画技法。他继承了文人画重文的优良传统，在绘画、书法、篆刻和画论诸方面，都获得了很高的成就。生机盎然、乐观进取，而不是冷逸荒寒、多愁善感。
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在他之前画禽鸟生动传神者首推海派任伯年，近代北方则首推王雪涛。孙其峰的禽鸟生动传神不让王雪涛，利落变化稍逊，而简练厚润、笔墨高雅似有过之。孙其峰在《谈谈花鸟画的发展问题》一文中将写意花鸟画概括为十六字：
“不求形似，不离形似、貌离神合、似非而是。”是他对形神理论的高度概括，也是他对“写意”绘画的独具见解的诠释。孙先生认为中国画不是技术而是一门艺术，应该看重它的艺术性而不是技术性，画画虽然离不开技术，但是用技术性的东西来等同艺术性是不对的。
孙先生艺术修养全面，绘画以花卉、翎毛、山水著称，书法于金文、小篆、隶书、草书、行书各体所无不擅，其中以草书、隶书、造诣高，师古而不泥古，能领略古法而行新奇。
