铜绿假单胞菌又称绿脓杆菌的东西，在自然界分布广泛，是土壤中最常见的细菌之一，它广泛分布于各种水、空气、正常人的皮肤、呼吸道和肠道等，易在潮湿的环境存活，对消毒剂、紫外线等具有较强的抵抗力。北京公众健康饮用水研究所常务所长赵飞虹告诉每日经济记者，铜绿假单胞菌在地表水中存在较多，并且属于致病菌，摄入到人体后，会引起人腹泻发烧等症状，目前要求水与饮料中这种菌的检出率必须为零。
矿泉水铜绿假单胞菌超标原因除杀菌不彻底外，桶装水生产业内人士表示，桶装水出现该菌的原因主要有原料水体受到污染，或生产过程中卫生控制不严格，从业人员未经消毒的手直接与矿泉水或容器内壁接触；再有就是包装材料清洗消毒有缺陷。
1.水源
大多数研究都否定铜绿假单胞菌天然存在于矿泉水水源中的可能。但从各国限定天然矿泉水水源不得检出铜绿假单胞菌的法规条款来看，这种致病菌对水源的污染确实存在。在实际上完全相同的地形、水文和化学条件下，同一厂家相邻的几处水源检出不同菌株，证明还存在不同的污染源。水源污染不易发现，只有污染严重的时候才能检出，可能这个时候对生产造成更大的危害了。
2.水处理
矿泉水生产水处理相对纯净水比较粗矿，为了保证矿物质含量没有使用逆渗透技术RO膜处理，这样一来，铜绿假单胞菌有机会透过精滤装置。再者，铜绿假单胞菌可粘附于管道、滤膜、贮水池及增压泵中繁殖，简单的反冲洗无法清除。铜绿假单胞菌对常规消毒技术抵抗力较强，矿泉水水处理除去它相对有点难度。
3.灌装
WHO将矿泉水铜绿假单胞菌列为人类皮肤污染指示菌。说明灌装主要是控制好防止交叉污染，铜绿假单胞菌并非耐受加工处理，而是交叉污染进入最终产品。简陋的生产工艺和设备是导致污染原因之一。铜绿假单胞菌在利用水流甚至气溶胶传播时，比其他微生物种类有优势，故控制工艺中的污染时，不应仅满足于防止铜绿假单胞菌凭借水的传播，空气净化也是重要环节。
矿泉水铜绿假单胞菌污染来源复杂，成因不是一两天的事情，而是长时间的累积问题
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