在水产养殖中，有些人喜欢用硝化细菌来调节水质，而更多的人喜欢用水产em菌来调节水质，两者都是属于微生物菌剂，调节水质使用是谁好谁劣呢？！其实两种菌剂的调水效果都是非常好的，差别的也是非常小的，硝化细菌是单一种类生物菌，而em菌所包含的功能性菌群更多一些。
硝化细菌是一种好氧性细菌，包括亚硝化菌和硝化菌。生活在有氧的水中或砂层中，在氮循环水质净化过程中扮演着很重要的角色。水中有有机污染源,净水细菌是靠水中有机污染而存活的，如果因为水中没有污染源存在，它们就无法长期生存。因此，在新水阶段就加入细菌是否有效，是值得研讨的。硝化细菌制剂是一种用于控制养殖池水自生氨浓度的处理剂，不仅使用相当方便，而且能发挥立竿见影的效果，故越来越受渔友的欢迎。使用时可直接将该剂散布于池中，不久即能发挥除铵的功效。
硝化细菌在水产养殖应用过程中存在的问题
(1)菌种变异问题。细菌在人工培养条件下,经过多次移种,若干代后,在形态、生化特性、抗原性等方面都会相应发生不同程度的变化。大多生产企业没有很好保存菌种,而且在生产中没有监控细菌变异的条件与技术,所以生产的成品得不到很好的质量保证。
(2)活菌浓度问题。活菌的贮存受温度、氧环境、光照、湿度等因素影响,在贮存过程中活菌浓度逐渐下降,应用后达不到预期效果。
(3)如何正确使用的问题。在水产养殖过程中大量使用广谱杀菌消毒剂和抗生素,当与硝化细菌等微生物制剂交叉使用时,大部分有益菌也被杀死,而不能在养殖池塘中建立稳定、有益的微生物群,收效甚微。
(4)使用安全性问题。硝化细菌制剂如果把致病菌带入养殖水体中,将会使水体微生物环境遭受破坏,造成养殖损失,甚至会影响人类的健康。
EM菌为一种混合菌一般包括芽孢菌、酵母菌、乳酸菌、光合细菌等有益菌类。可用于食品添加，养殖病害防治，污水治理等等。使用乳酸菌混合饲料养殖南美白对虾，除具有生长速度快、抗病力强、日食饵量快而多、养殖周期短、卖相好等优点外，混合饲料在水中的溶解速度慢、不容易污染水质。深受对虾（各种水产）养殖户的喜爱，这是一个具有广阔前景的新型水产饲料产业。日本在许多年以前已经在水产养殖上使用天时好乳酸菌，养殖效果非常明显，且对虾品质优良。
两种菌各司其职，好坏分类具体要看使用者使用的目的，也就是想要的是什么，达到什么样的效果，如果目的相同要看使用的方法，用量等因素考虑。两种产品同为微生物菌，互不影响使用效果，想明确了解其产品使用效果，的办法就是亲身体验了。
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